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黄海所研制出基因芯片“黄海芯1号” 助力对虾育种

2021-6-23 10:28| 发布者: 御城雪| 查看: 89808| 评论: 0|来自: 黄海水产研究所育种室

摘要: 中国水产频道报道,孔杰研究员团队研制出基因芯片“黄海芯1号”助力对虾育种。
  中国水产频道报道,

  孔杰研究员团队研制出基因芯片“黄海芯1号”助力对虾育种

  基因芯片是提升育种效率、培育抗病、抗逆及优质等新品种的重要分子工具。近年来,针对对虾基因组育种缺乏低成本、高通量的基因芯片现状,中国水产科学研究院黄海水产研究所孔杰研究员团队研制出40K SNP基因芯片“黄海芯1号”。依据多代系谱,采用一步法基因组选择技术,“黄海芯1号”已经应用于对虾的商业化育种中,在提高致急性肝胰腺坏死病副溶血弧菌(VpAHPND)、白斑综合征病毒(WSSV)抗性和生长速度等方面取得显著进展。

  研究团队对世界上重要对虾养殖群体和品系进行了全基因组重测序,获得6百万个有效SNP标记,经过整合WSSV抗性、氨氮耐受性、饲料转化效率等相关SNP位点,选留45815个标记并构建了液相芯片。利用该芯片的基因型检测结果,对VpAHPND和WSSV侵染的抗性开展一步法基因组选择,准确性比传统的BLUP方法高29%-91%。该团队已经与石家庄博瑞迪生物技术有限公司签约,联合开展育种技术服务与SNP基因型检测服务。目前,“黄海芯1号”已推广应用于4个凡纳滨对虾的遗传育种项目,分型个体数量超过2000尾。

  对虾40K SNP育种芯片“黄海芯1号”的研发,为凡纳滨对虾基因组亲缘关系鉴定、遗传结构与遗传多样性分析、多性状基因组选择等提供了重要工具,对进一步推动对虾种业的快速发展起到至关重要的作用。

  图1,“黄海芯1号”对虾基因芯片的SNP位点分布图

  图2,世界上主要对虾品系的“黄海芯1号”聚类图

  图3,世界上主要对虾品系的“黄海芯1号”亲缘关系热图本文转自【黄海水产研究所育种室】。如有版权问题,敬请联系wx@fishfirst.cn



  【关键字】:对虾  基因芯片  育种  水产养殖
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