水质的任何变化都是由特定原因引起的，俗语讲“养鱼先养水”，就是讲的水质管理。所谓水质管理，就是根据池塘水色或水质化学指标的变化动态，对水质状况能否满足鱼虾正常生长做出分析判断，如果水质的变化威胁到鱼虾的生长安全，就应采取相应的调控措施，使水质满足鱼虾正常生长发育所要求的条件。水质管理是鱼虾疾病防治的重要基础性工作，包括诊断和调控改良两个内容。
一般情况下，在鱼病诊断时，首先要对水质状况进行诊断。如果经过检查，判定水质良好，才可以判定鱼虾疾病的直接病因可能是寄生虫、细菌等病原生物。日常池塘管理中也应如此，如发现鱼虾有异常，应该首先检查水质。如果水质存在某些问题，应首先根据不同的原因对水质进行相应改良处理，同时采取相应的疾病治疗措施。水质管理要遵循以下程序。
      1. 观察水色和浮游植物的变化
水色是水质状况的最直观表现。几乎所有的水质化学指标和浮游植物变化都会通过水色的变化表现出来，而水色的每一种变化都有特定的原因。因此，要注意观察水色的变化，掌握水色的变化规律和日常变化动态。技术人员要对各种情况下水色的变化做到心中有数，一旦发现异常，要尽早采取水质改良措施。
      2. 观察鱼虾的活动状态
鱼虾活动与水质状况有密不可分的关系，水质的变化，特别是水色突变，会引起鱼虾异常的行为反应。轻度水质变化，会引起鱼虾溜边、游动缓慢、不吃食等，水质突变时，会引起鱼虾浮头、泛塘、中毒、游塘、池底死亡等。一般情况下，当水质变化为不适于鱼虾生存时，鱼虾首先会出现浮头的现象。
      3. 检测水质化学指标
日常池塘管理过程中，除了关注以上两个方面的变化外，还应定期对水体pH值、氨氮、亚硝酸盐、溶解氧等化学指标进行检测，以掌握水质变化的动态。科学家们已基本研究了所有主要养殖鱼虾类的生存条件，除了国家《渔业水质标准》中规定的指标外，pH值、氨氮、亚硝酸盐、溶解氧等关键的水质指标都有相应的数据。例如池塘溶解氧应是多少? pH值多少? 表2-2总结了这些方面现有的数据。通过连续检测水体的化学指标，可以判断水质的变化动态及水质是否符合鱼虾正常生长发育所应具备的条件。
4. 正确诊断，并采取合理的水质调控措施 
在以上三方面诊断的基础上，要根据水质变化的原理，综合判断引起水质变化的原因，并采取相应的水质调控措施，使水质保持在适宜鱼虾正常生长的状态。