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清塘应在修整池塘结束后、鱼苗放养前10～15天进行，即用各种药物杀死野杂鱼、致病菌、寄生虫和其他敌害生物。清塘时常因养殖品种的不同、多发疾病的不同及药物来源便利而使用不同类的清塘药物，如苗种池常使用通杀型的清塘剂，而虾蟹养殖塘中常使用选杀型的清塘药。
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清塘的药物种类很多，应根据各地特点选择应用。这里介绍一些常用且效果较好的方法。
01
生石灰
利用生石灰清塘有两种方法：
一种是干法清塘：常规做法是将池水排干或排到水留6～10厘米深，有些地区是在塘内底部挖若干个水坑，将生石灰分别放入水坑中溶化，不等坑中水冷却，将坑中石灰水向池塘内四处泼洒。也可以将生石灰用水发散后趁热人工干洒于池塘，还可以将生石灰加水调成石灰乳趁热人工泼洒。
生石灰每亩池塘用量60～75千克，视池塘底泥老化程度适当增减。第二天可以用铁耙或楼梯拖动从而搅动塘泥，使生石灰浆与淤泥充分混合，以发挥其改善底质的功效。
另外一种方法是带水清塘：即不排出池水施用生石灰，对于水源缺乏或不便干塘的适用此法。可以直接倾倒到池塘中，但是最好是用竹箩筐盛装生石灰，由人穿着水裤下塘，端着箩筐在水塘中左右振荡，以保证生石灰在水中充分溶解。也可以将生石灰用水发散后趁热人工干洒于池塘，还可以将生石灰加水调成石灰乳趁热人工泼洒。
生石灰每亩每米水深用量125～150千克。其优点是防病效果比干池清塘更好，还可杀绝池坎上水位中的鳅、鳝等鱼害动物，缺点是成本高，生石灰用量比较大。
利用生石灰清塘是因为生石灰遇水会生成氢氧化钙，在短时间内使池水pH值上升到11以上，同时放出大量的热，因此可以杀灭野杂鱼类、蛙卵、蝌蚪、昆虫、杂虾蟹、蚂蟥、丝状藻类、寄生虫、大多数病菌。生石灰清塘后产生的氢氧化钙可以保持池水略显碱性，防止酸化。生石灰可改良底质的通透性，增加钙肥，为动植物提供营养物质。
用时需现买现用，其清塘效果受水体碱度影响。但必须选择刚刚出窖的块状石灰，而不要选择那些块少粉多的货色，因为粉灰是生石灰潮解后与空气中二氧化碳结合形成的碳酸钙，已经失去清塘功效了。但必须注意的是碱性较强的水体不能用此法清塘。
注意身体肌肤不要直接接触正在溶解的生石灰，避免烫伤。需要7～10天后药效消失才能将鱼虾苗入池。
02
漂白粉
漂白粉是使用了多年的第一代消毒剂，又称含氯石灰，为白色颗粒状粉末，但必须含氯有效成份30%才有效果。
用漂白粉清塘有两种方法：
干法清塘：将池水排干或排到水留6～10厘米深，漂白粉用量为每亩5～15千克，漂白粉清塘最好水留6～10厘米深为好。
另一种是带水清塘，漂白粉用量为20克/立方米水体(即每米水深15～20千克/亩)。
清塘后4～5天药性消失，即可放鱼。漂白粉的杀菌效果比生石灰强，漂白粉清塘具有药力消失快、用药量少、有利于池塘的周转等优点，缺点是没有使池塘增加肥效的作用。
漂白粉有效氯含量在30％左右，遇水后分解出次氯酸和次氯酸离子，而次氯酸与次氯酸离子极不稳定，可放出活性氯和初生态氧，杀死鱼类、蛭类、蝌蚪、螺、水生昆虫、寄生虫和病原体。但漂白粉有效氯含量不稳定，易挥发，使用时应先检测其有效含量。
03
茶粕
以茶粕为代表的植物类清塘药，其共同特点是均有杀鱼的作用，部分的杀螺功能，但往往用量过大，且杀鱼不彻底，更无杀菌的作用，使用时常需其他药物配合才能达到彻底清塘的目的。
1.茶粕
茶粕是油茶的果实经过榨油之后剩下的渣滓。茶粕含有皂素，通常含量有7%～8%。皂素又称皂角苷，是一种溶血性毒素，能使鱼的红细胞溶化，故能杀死泥鳅等各种野杂鱼类、螺蛳、河蚌、蛙卵、蝌蚪和一部分水生昆虫，但对病菌、虾蟹毒力不强，常用于虾蟹养殖塘中清塘。
皂素易溶于碱性水中，使用时加入少量石灰水，药效更佳。由于茶粕的蛋白质含量较高，因此它还是一种高效饼肥，对淤泥少、底质贫瘠的池塘可起到增肥作用。
使用时将茶粕敲成小块或细粒状，放在容器中，在水温25℃左右浸泡一昼夜即可使用，施用时再加水，均匀泼洒于全池，池塘水深1米用量为35～45千克，上述用量可视塘内野杂鱼的数量而增减，对不钻泥的鱼类用量少点，反之则多些。需要7～10天后药效消失才能将鱼虾苗入池。
茶粕的特点主要有四点：
①绿色药物，无毒性残存，对人体无影响，使用安全；
②不杀死水草，对水草有促长效果；
③对虾、蟹幼体无副作用，并可促进虾、蟹脱壳；
④具有增加肥效的作用，在繁育虾苗和培育幼蟹的池塘使用，可明显提高虾苗和幼蟹的出塘率。
04
鱼藤精
利用鱼藤和鱼藤属植物鲜根在水中捣碎，用其乳液来毒鱼已有数世纪之久的历史。水产养殖清塘时常用鱼藤精，鱼藤精的有效成分是从豆科植物鱼藤的根部提取的物质，鱼藤精一般含25%鱼藤酮。鱼藤精清塘用量为2克/立方米水体。鱼藤精能杀死野杂鱼类和部分水生昆虫，对致病菌也具有一定的杀灭作用。对虾蟹类及饵料生物毒性较低。因此，适用于虾蟹池的清池除害。但在虾蟹类脱壳时应避用，以免造成死亡。
注意事项
1.清塘效果与环境有很大关系
清塘适宜选择晴天，这样温度较高，药物的作用比较强烈，能提高清塘的效果。如果清塘时，长期低温，清塘药物难以降解，易沉淀在池底，被砂土吸附，缓慢释放易导致所放苗种死亡。
2.试水下鱼
由于水温的差异及各种水产动物对药物耐受程度的不同，放养前必须用养殖水产品试一试（俗称试水），在证明清塘药物毒性消失后，方可大批放养水产苗种。