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本帖最后由 渔歌子 于 2016-6-7 11:11 编辑
最新研究结果显示:草鱼是通过肠道微生物来利用所摄食的大量植物。
Metatranscriptomicdiscoveryofplantbiomass-degradingcapacityfromgrasscarpintestinalmicrobiomes
宏转录组学是在宏基因组学之后兴起的一门新学科,能从转录水平研究复杂微生物群落变化,能更好地挖掘潜在的新基因。
尽管鱼类的经济价值很重要,但是鱼类肠道微生物组的生态学和代谢能力在很大程度上还是未知的。草鱼(Ctenopharyngodonidellus)是一种草食性淡水鱼类,我们采用宏转录组测序的方法测定了草鱼肠道微生物的类群。实验结果显示,草鱼肠道主要微生物类群为厚壁菌门、梭菌门、变形菌门和拟杆菌门。比较不同食物草鱼肠道微生物转录组,我们发现宿主的食物会影响肠道微生物的代谢。通过转录组数据分析我们发现草鱼肠道存在参与纤维素、木聚糖、甘露聚糖和果胶主链降解的水解酶,此外,在草鱼肠道发现有大量的可降解非纤维素多糖的葡萄糖水解酶。草鱼肠道微生物主要的COG类群与能量的产生、转换以及碳水化合物和氨基酸的转运、代谢有关。以上结果说明草鱼肠道微生物可以通过对碳水化合物的分解、发酵为自身和宿主提供能量。草鱼肠道微生物反映了宿主在能量获得方面的适应进化能力,即草鱼通过大量摄食植物性食物,通过对植物细胞内多糖的利用,而不是通过对纤维素的降解,获得能量。(转处中国水产论坛/fishdis)
Metatranscriptomic discovery of plant biomass-degrading capacity.rar
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